Kirito trata de llegar al Árbol del mundo en el popular RPG de realidad virtual Alfheim Online en un intento de hacer despertar a Asuna, que sigue en coma.
En ALO, Kirito conoce a Leafa, una joven sylph fascinada por los jugadores hábiles con las espadas, que se ofrece a hacerle de guía para llegar al árbol.
Sin embargo...
En realidad, Leafa no es otra que Suguha, la hermana menor de Kazuto Kirigaya, y ha aceptado ayudar a su personaje, Kirito, sin saber que en realidad es su hermano mayor. ¡Continúan las aventuras de los dos mientras aúnan fuerzas en su viaje hasta el Árbol del mundo!